libraries/CXSparse: Upgraded for version 3.1.2.

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diff --git a/libraries/CXSparse/autotoolize.diff b/libraries/CXSparse/autotoolize.diff
index 151b75a9ae..524c26f0f8 100644
--- a/libraries/CXSparse/autotoolize.diff
+++ b/libraries/CXSparse/autotoolize.diff
@@ -3,7 +3,7 @@ new file mode 100644
 --- /dev/null
 +++ b/Demo/Makefile.am
 @@ -0,0 +1,131 @@
-+AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/Include $(UFCONFIG_CFLAGS)
++AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/Include $(SUITESPARSECONFIG_CFLAGS)
 +LDADD = $(top_builddir)/Source/libcxsparse.la
 +
 +noinst_HEADERS = \
@@ -53,93 +53,92 @@ new file mode 100644
 +cs_ldemo_CPPFLAGS = $(AM_CPPFLAGS) -DCS_LONG
 +
 +MATRICES = \
-+	../Matrix/ash219 \
-+	../Matrix/bcsstk01 \
-+	../Matrix/bcsstk16 \
-+	../Matrix/c4 \
-+	../Matrix/c_mbeacxc \
-+	../Matrix/c_west0067 \
-+	../Matrix/fs_183_1 \
-+	../Matrix/lp_afiro \
-+	../Matrix/mbeacxc \
-+	../Matrix/mhd1280b \
-+	../Matrix/neumann \
-+	../Matrix/qc324 \
-+	../Matrix/t1 \
-+	../Matrix/t2 \
-+	../Matrix/t3 \
-+	../Matrix/t4 \
-+	../Matrix/west0067 \
-+	../Matrix/young1c
++	$(top_srcdir)/Matrix/ash219 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/c4 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/c_mbeacxc \
++	$(top_srcdir)/Matrix/c_west0067 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/fs_183_1 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/lp_afiro \
++	$(top_srcdir)/Matrix/mbeacxc \
++	$(top_srcdir)/Matrix/mhd1280b \
++	$(top_srcdir)/Matrix/neumann \
++	$(top_srcdir)/Matrix/qc324 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/t1 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/t2 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/t3 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/t4 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/west0067 \
++	$(top_srcdir)/Matrix/young1c
 +
 +check-local: $(check_PROGRAMS) $(MATRICES)
-+	-./cs_demo1 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/fs_183_1
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/west0067
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/lp_afiro
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/ash219
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/mbeacxc
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_demo3 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_demo2 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_demo3 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_di_demo1 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/fs_183_1
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/west0067
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/lp_afiro
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/ash219
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/mbeacxc
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_di_demo3 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_di_demo2 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_di_demo3 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_dl_demo1 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/t1
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/fs_183_1
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/west0067
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/lp_afiro
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/ash219
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/mbeacxc
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_dl_demo3 < ../Matrix/bcsstk01
-+	-./cs_dl_demo2 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_dl_demo3 < ../Matrix/bcsstk16
-+	-./cs_ci_demo1 < ../Matrix/t2
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/t2
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/t3
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/t4
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/c_west0067
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/c_mbeacxc
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/young1c
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/qc324
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/neumann
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/c4
-+	-./cs_ci_demo3 < ../Matrix/c4
-+	-./cs_ci_demo2 < ../Matrix/mhd1280b
-+	-./cs_ci_demo3 < ../Matrix/mhd1280b
-+	-./cs_cl_demo1 < ../Matrix/t2
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/t2
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/t3
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/t4
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/c_west0067
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/c_mbeacxc
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/young1c
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/qc324
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/neumann
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/c4
-+	-./cs_cl_demo3 < ../Matrix/c4
-+	-./cs_cl_demo2 < ../Matrix/mhd1280b
-+	-./cs_cl_demo3 < ../Matrix/mhd1280b
-+	-./cs_idemo < ../Matrix/t2
-+	-./cs_ldemo < ../Matrix/t2
++	-./cs_demo1 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/fs_183_1
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/west0067
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/lp_afiro
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/ash219
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/mbeacxc
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_di_demo1 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/fs_183_1
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/west0067
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/lp_afiro
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/ash219
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/mbeacxc
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_di_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_di_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_di_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_dl_demo1 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t1
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/fs_183_1
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/west0067
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/lp_afiro
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/ash219
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/mbeacxc
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_dl_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk01
++	-./cs_dl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_dl_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/bcsstk16
++	-./cs_ci_demo1 < $(top_srcdir)/Matrix/t2
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t2
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t3
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t4
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c_west0067
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c_mbeacxc
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/young1c
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/qc324
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/neumann
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c4
++	-./cs_ci_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/c4
++	-./cs_ci_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/mhd1280b
++	-./cs_ci_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/mhd1280b
++	-./cs_cl_demo1 < $(top_srcdir)/Matrix/t2
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t2
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t3
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/t4
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c_west0067
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c_mbeacxc
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/young1c
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/qc324
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/neumann
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/c4
++	-./cs_cl_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/c4
++	-./cs_cl_demo2 < $(top_srcdir)/Matrix/mhd1280b
++	-./cs_cl_demo3 < $(top_srcdir)/Matrix/mhd1280b
++	-./cs_idemo < $(top_srcdir)/Matrix/t2
++	-./cs_ldemo < $(top_srcdir)/Matrix/t2
 diff --git a/Include/Makefile.am b/Include/Makefile.am
 new file mode 100644
 --- /dev/null
 +++ b/Include/Makefile.am
-@@ -0,0 +1,2 @@
-+pkgincludedir = $(includedir)/cxsparse
+@@ -0,0 +1 @@
 +pkginclude_HEADERS = cs.h
 diff --git a/Makefile.am b/Makefile.am
 new file mode 100644
@@ -184,7 +183,7 @@ new file mode 100644
 --- /dev/null
 +++ b/Source/Makefile.am
 @@ -0,0 +1,72 @@
-+AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/Include $(UFCONFIG_CFLAGS)
++AM_CPPFLAGS = -I$(top_srcdir)/Include $(SUITESPARSECONFIG_CFLAGS)
 +
 +CS_SOURCE = \
 +	cs_add.c \
@@ -255,35 +254,43 @@ new file mode 100644
 +
 +libcxsparse_la_SOURCES = cs_convert.c
 +libcxsparse_la_LIBADD = libcxsparse_di.la libcxsparse_dl.la libcxsparse_ci.la libcxsparse_cl.la -lm
-+libcxsparse_la_LDFLAGS = -no-undefined -version-info 4:5:2
++libcxsparse_la_LDFLAGS = -no-undefined -version-number 3:1:2
 diff --git a/configure.ac b/configure.ac
 new file mode 100644
 --- /dev/null
 +++ b/configure.ac
-@@ -0,0 +1,37 @@
-+AC_PREREQ([2.68])
-+AC_INIT([CXSparse],[2.2.5],[davis@cise.ufl.edu])
+@@ -0,0 +1,45 @@
++#                                               -*- Autoconf -*-
++# Process this file with autoconf to produce a configure script.
++
++AC_PREREQ([2.69])
++AC_INIT([CXSparse],[3.1.2],[DrTimothyAldenDavis@gmail.com],[cxsparse],[http://www.suitesparse.com/])
 +AC_CONFIG_SRCDIR([Source/cs_print.c])
-+AC_CONFIG_HEADER([config.h])
++AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
 +AM_INIT_AUTOMAKE([foreign])
 +LT_INIT
 +
++# Checks for programs.
 +AC_PROG_INSTALL
 +AC_PROG_CC
 +
 +LIBS_SAVED=$LIBS
 +
++# Checks for libraries.
 +AC_CHECK_LIB([m], [sqrt])
 +
-+AC_CHECK_HEADERS([limits.h stdlib.h])
-+
 +PKG_PROG_PKG_CONFIG
-+PKG_CHECK_MODULES([UFCONFIG],[ufconfig],
++PKG_CHECK_MODULES([SUITESPARSECONFIG],[suitesparseconfig],
 +	[],
-+	[AC_MSG_ERROR([cannot find ufconfig])])
++	[AC_MSG_ERROR([cannot find suitesparseconfig])])
++
++# Checks for header files.
++AC_CHECK_HEADERS([limits.h stdlib.h])
 +
++# Checks for typedefs, structures, and compiler characteristics.
 +AC_TYPE_SIZE_T
 +
++# Checks for library functions.
 +AC_FUNC_MALLOC
 +AC_FUNC_REALLOC
 +AC_CHECK_FUNCS([sqrt])
@@ -302,7 +309,7 @@ diff --git a/cxsparse.pc.in b/cxsparse.pc.in
 new file mode 100644
 --- /dev/null
 +++ b/cxsparse.pc.in
-@@ -0,0 +1,12 @@
+@@ -0,0 +1,13 @@
 +prefix=@prefix@
 +exec_prefix=@exec_prefix@
 +libdir=@libdir@
@@ -311,7 +318,8 @@ new file mode 100644
 +Name: @PACKAGE_NAME@
 +Description: An extended version of CSparse
 +Version: @PACKAGE_VERSION@
-+Requires.private: ufconfig
++URL: @PACKAGE_URL@
++Requires.private: suitesparseconfig
 +Libs: -L${libdir} -lcxsparse
 +Libs.private: -lm
 +Cflags: -I${includedir}/cxsparse